巴彦淖尔位于举世闻名的河套平原和乌拉特草原上，黄河流经境内。湖泊资源较为丰富，有大小湖泊300多个。建有德岭山水库、二郎山水库、小怒气水库等水库。也用世界上最长的水库大坝，主要钓场在德岭山水库，和一些淡水湖泊。主要鱼种鲤、鲫、草鱼、鲢、鳙、东北雅罗鱼、鲶鱼等。